Вход

Просмотр полной версии : Влияние мочевины на ПЦР


Alive
10.06.2010, 11:28
На сайте лаборатории "Инвитро" в описаниях некоторых ПЦР-анализов на ИППП встречается такое пояснение:

Интерпретация результата «обнаружено»:
в анализируемом образце биологического материала найден фрагмент ДНК, специфичный для N.gonorrhoeae;
в анализируемом образце биологического материала в результате нарушения правил забора материала находится химическое соединение (мочевина), приводящее к регистрации ложноположительного результата.


Пример: [Ссылки могут видеть только зарегистрированные и активированные пользователи]

Какова природа такого эффекта и где об этом можно почитать? Каким образом может быть нарушена технология взятия соскоба из уретры, чтобы в пробе оказалась мочевина?

Dr.Anisimova
10.06.2010, 15:29
[Ссылки могут видеть только зарегистрированные и активированные пользователи] %A6%D0%A0+%D0%BC%D0%BE%D1%87%D0%B5%D0%B2%D0%B8%D0% BD%D0%B0&cd=11&hl=en&ct=clnk&client=pub-2698861478625135
"Чувствительность ПЦР-анализа при установленных оптимальных параметрах реакции зависит от процедуры подготовки исследуемого биологического материала, включающей экстракцию ДНК\РНК-мишени. Благодаря этому происходит не только концентрирование исследуемой ДНК\РНК-матрицы в малом объеме, но и удаление ингибиторов ПЦР. При этом определенная специфика ингибиторов характерна для конкретных разновидностей биологического материала.
При исследовании образцов цельной крови ингибирование ПЦР происходит, по нашему мнению, при наличии детергентов, лактофферина и гемоглобина, но наибольшее влияние оказывает плазма, содержащая ингибирующие ионы или низкомолекулярные соединения. В биоптатах ПЦР ингибируют консерванты - ртутьсодержащие соединения, формалин и рибонуклеат ванадия, в мокроте – гемоглобин и муколитические вещества, в частности, N-ацетил- L-цистеин и дитиотретиол, в моче – мочевина, соскобах эпителиальных клеток из уретры и цервикального канала – гемоглобин при наличии сгустков крови, слизь."
- т.е. пока это больше предположительно "ингибирующее" влияние(не так много исследований), только скорее всего будет не ложно- положительный, а наоборот, соответственно, из-за снижения чувствительности
- в сомнительных случаях(ложноотрицательные в частности) просто анализ пересдается(можно в другой лаборатории), либо через определенное время контроль повторяется